Tại Tỉnh Điện Biên, công tác quản lý, xử lý chất thải y tế được Uỷ ban Nhân dân tỉnh, lãnh đạo Sở Y tế, các ngành liên quan, quan tâm, chỉ đạo sâu sát. UBND tỉnh và Sở Y tế đã lồng ghép việc thực hiện xây dựng và hoàn thiện hệ thống xử lý chất thải y tế nguy hại ( chất thải lỏng và chất thải rắn ) vào các đề án hỗ trợ y tế. ưu tiên nội dung xây dựng hệ thống xử lý chất thải khi triển khai thực hiện Đề án đầu tư xây dựng, cải tạo, nâng cấp các Bệnh viện Đa khoa tuyến tỉnh và các trung tâm y tế huyện thị . Triển khai các văn bản của Bộ Y tế về tăng cường công tác quản lý và xử lý chất thải . Mở các lớp đào tạo, tập huấn về công tác quản lý môi trường và công tác quản lý, Qui chế xử lý chất thải y tế đến từng đơn vị. Đảm bảo cho kế hoạch xử lý chất thải được cập nhật và phù hợp.Chỉ đạo, hướng dẫn, tăng cường công tác kiểm tra việc thực hiện Quản lý và xử lý chất thải y tế. Cùng với các đơn vị tháo gỡ các khó khăn vướng mắc tại cơ sở.

Tuy nhiên còn có rất nhiều khó khăn ảnh hưởng đến công tác xử lý chất thải y tế tại tỉnh Điện Biên:

- Hầu hết các Bệnh viện và Trung tâm Y tế cơ sở vật chất đã xây dựng từ lâu, khi xây dựng không có thiết kế các công trình xử lý chất thải.

- Điện biên là tỉnh miền núi đặc biệt khó khăn, hơn 90% người dân có thẻ BHYT. Tại các cơ sở y tế tuyến huyện nguồn thu thấp, các đơn vị y tế không thể cân đối được nguồn chi cho hoạt động xử lý chất thải vì vậy việc đầu tư kinh phí phục vụ mua sắm các phương tiện thu gom, vận chuyển, vận hành hệ thống xử lý chất thải rắn và lỏng gặp nhiều khó khăn.thiếu các dụng cụ thu gom phân loại như thùng rác, túi ni lon, hộp đựng vật sắc nhọn theo qui chuẩn.

- Việc xử lý chất thải lây nhiễm còn gặp nhiều khó khăn. Toàn tỉnh mới có 2 đơn vị y tế được xây dựng lò đốt rác theo tiêu chuẩn. Các đơn vị còn lại chưa được đầu tư xây dựng lò đốt rác theo qui chuẩn, một số đơn vị đang trong quá trình xây dựng hệ thống xử lý chất thải.Trong khi đó việc đào hố chôn lấp chất thải y tế tại các Trung tâm Y tế tuyến huyện và các Phòng khám Đa khoa khu vực không có địa điểm chôn lấp chất thải có đủ điều kiện đáp ứng các tiêu chuẩn theo qui định.

- Hầu hết các điểm tập trung lưu gữi chất thải trong Bệnh viện, vệ sinh không đảm bảo, do không có mái che, không có hàng rào bảo vệ. Các loại côn trùng, súc vật, và cả những người không có nhiệm vụ dễ xâm nhập.

-Chưa có cơ sở vận chuyển chất thải y tế nguy hại được cơ quan có thẩm quyền cho phép hoạt động, vì vậy việc vận chuyển chất thải y tế nguy hại từ các Trung tâm chuyên khoa, các phòng khám y tế tư nhân đến địa điểm lò đốt rác của Bệnh viện Đa khoa Tỉnh chưa đảm bảo yêu cầu về phương tiện chuyên chở chất thải theo qui định.

Hiện trạng xử lý chất thải tại các cơ sở y tế tỉnh Điện biên còn gặp rất nhiều khó khăn, thiếu thốn về tài chính, phương tiện. Lãnh đạo Sở Y tế và lãnh đạo các đơn vị đang tập trung chỉ đạo giải quyết dứt điểm một số khó khăn và cùng đơn vị tháo gớ những khó khăn vướng mắc tại đơn vị.